战舰开发板输入捕获测量LED闪烁时间出现误差

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我今天看了输入捕获，然后用TIM3中断来让LED灯以1秒间隔闪烁，通过输入捕获来看闪烁时间。结果发现，LED1黄灯测得时间基本准确，但是LED0的时间却相差了大概0.5%，请问各位大神们这是什么原因？

几个不同的时间是因为在改跳线

多次测量结果一致

两个程序完全相同，只是改了一下中断函数，同时更改了跳线。

void TIM3_IRQHandler(void)
{
 if( TIM_GetITStatus(TIM3,TIM_IT_Update) != RESET)        
 {
  TIM_ClearITPendingBit(TIM3, TIM_IT_Update  );          
  LED1 = !LED1;
 }
}

只修改了一行

  LED0 = !LED0;

正点原子

是不是主函数也在对DS0取反....